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Experiment: Transcriptome analysis of cho1 mutant during and after seed germination
Experiment Description
NASCArrays Experiment Reference Number: NASCARRAYS-497
Arabidopsis chotto1 (cho1) mutants show resistance to an ABA analog, (-)-R-ABA, in seed germination. CHO1 gene encodes a double AP2 domain transcription factors (At5g57390), and act in the ABI4-dependent genetic pathway. cho1 mutants are also resistant to high-concentrations of nitrate (>25 mM KNO3) during seed germination and post-germination growth. To reveal the role of CHO1 gene in seed germination and post-germination growth, we carried out gene expression analysis of cho1 and wild type (Col) seeds under 25-mM nitrate condition. Seeds were imbibed on the filter paper moistened with 25 mM KNO3 in 24 or 48 hours. Total RNA was prepared from dry seeds and imbibed seeds and was used for the microarray analysis. We carried out duplicate microarray analysis using independent seed batches.Ref):Nambara et al., Genetics 161: 1247-1255 (2002).Yamagishi et al., Plant Cell Physiol. 50: 330-340 (2009)
About the Experimenter
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Slides in this Experiment
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Hybridisation Set: Kiyoshi: Transcriptome analysis of cho1 mutant during and after seed germination_genome
Slide: Tatematsu_1-1_WT-Col-dry-seeds_Rep1_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Slide: Tatematsu_1-3_WT-Col-seeds-24-h-imbibition-of-nitrate_Rep1_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Slide: Tatematsu_1-5_WT-Col-seeds-48-h-imbibition-of-nitrate_Rep1_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Slide: Tatematsu_1-7_cho1-dry-seeds_Rep1_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Slide: Tatematsu_1-8_cho1-dry-seeds_Rep2_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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