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Experiment: Arabidopsis E2F target genes
Experiment Description
NASCArrays Experiment Reference Number: NASCARRAYS-337
Entry into the S phase of the cell cycle is controlled by the E2F transcitption factors that induce the transcription of genes required for cell cycle progression and DNA replication. To identify E2F target genes of Arabidopsis on a genome-wide scale, the transcriptome of wild-type plants was compared with that one of plants ectopically expressing the E2Fa-DPa genes. In four independent experiments, E2Fa-DPa overexpressing plants were grown side-to-side with wild type (Col-0) plants. RNA was extracted from 6-day-old seedlings. Each biological sample was harvested and processed independently, and finally all probed individually to Affymetrix ATH1 microarrays, resulting into 8 hybridization signals for each probeset.
About the Experimenter
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Slides in this Experiment
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Hybridisation Set: De Veylder: Arabidopsis E2F target genes_genome
Slide: De Veylder_1-1_wildtype_Rep1_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
Summary InformationThis slide has had 1 extract(s) hybridised to it (1-colour).
The slide used was "Affymetrix ATH1 Arabidopsis Genome Array". Click on the options above for more information about this slide and its preparation. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hybridisation Protocol Information
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Protocols for BioSource 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Extraction Protocol Information
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Slide Information
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Scanning Protocol Information
| Image Analysis Information
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Slide: De Veylder_1-2_wildtype_Rep2_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Protocols for BioSource 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Scanning Protocol Information
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Slide: De Veylder_1-3_wildtype_Rep3_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Hybridisation Protocol Information
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Protocols for BioSource 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Extraction Protocol Information
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Slide Information
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Scanning Protocol Information
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Slide: De Veylder_1-4_wildtype_Rep4_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Protocols for BioSource 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Slide: De Veylder_1-5_E2Fa-Dpa_Rep1_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Protocols for BioSource 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Extraction Protocol Information
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Slide: De Veylder_1-6_E2Fa-Dpa_Rep2_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Slide: De Veylder_1-7_E2Fa-Dpa_Rep3_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Slide: De Veylder_1-8_E2Fa-Dpa_Rep4_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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