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Experiment: Transcriptomic analysis of inducible RNAi transgenic plants
Experiment Description
NASCArrays Experiment Reference Number: NASCARRAYS-622
The objective of this experiment is to proof the concept of tetrapyrrole-mediated signaling by analysis of the primary response on nuclear transcription by using an inducible transgene expression system. Transgenic plants with chemical induced silencing (RNAi) of genes encoding enzymes of the Mg branch (chlH, chlM, chl27) will allow us to explore time-resolved early variations of nuclear gene expression upon induced changes of activities of these specific steps in the chlorophyll-synthesizing branch of tetrapyrrole biosynthesis.For transcriptome analysis we used green tissue of three weeks old arabidopsis seedlings treated with dexamethasone for 24 h. The seedlings were grown in little pots on soil under the same conditions.
About the Experimenter
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Slides in this Experiment
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Hybridisation Set: Salinas Hartwig: Transcriptomic analysis of inducible RNAi transgenic plants
Slide: Salinas-Hartwig_622-1_Col-0_Rep1_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
Summary InformationThis slide has had 1 extract(s) hybridised to it (1-colour).
The slide used was "Affymetrix ATH1 Arabidopsis Genome Array". Click on the options above for more information about this slide and its preparation. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hybridisation Protocol Information
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Protocols for BioSource 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Extraction Protocol Information
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Slide Information
| Array Design Information
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Scanning Protocol Information
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Slide: Salinas-Hartwig_622-2_Col-0_Rep2_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Hybridisation Protocol Information
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Protocols for BioSource 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Extraction Protocol Information
| Labelling Protocol Information
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Slide Information
| Array Design Information
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Scanning Protocol Information
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Slide: Salinas-Hartwig_622-3_ChlH-RNAi_Rep1_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Hybridisation Protocol Information
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Protocols for BioSource 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Extraction Protocol Information
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Slide Information
| Array Design Information
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Scanning Protocol Information
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Slide: Salinas-Hartwig_622-4_ChlH-RNAi_Rep2_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Hybridisation Protocol Information
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Extraction Protocol Information
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Slide Information
| Array Design Information
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Slide: Salinas-Hartwig_622-5_ChlM-RNAi _Rep1_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Hybridisation Protocol Information
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Protocols for BioSource 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Extraction Protocol Information
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Slide Information
| Array Design Information
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Scanning Protocol Information
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Slide: Salinas-Hartwig_622-6_ChlM-RNAi _Rep2_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Protocols for BioSource 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Extraction Protocol Information
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Slide Information
| Array Design Information
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Scanning Protocol Information
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Slide: Salinas-Hartwig_622-7_Chl27-RNAi_Rep1_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Hybridisation Protocol Information
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Protocols for BioSource 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Extraction Protocol Information
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Slide Information
| Array Design Information
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Scanning Protocol Information
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Slide: Salinas-Hartwig_622-8_Chl27-RNAi_Rep2_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Protocols for BioSource 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Slide Information
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