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Experiment: Arabidopsis thaliana leaves treated with Pseudomonas syringae ES4326
Experiment Description
NASCArrays Experiment Reference Number: NASCARRAYS-414
In order to better understand the transcriptional networks triggered by pathogen inoculation, we monitored gene expression in Arabidopsis leaves inoculated with Pseudomonas syringae ES4326. Individual leaves of Col-0 plants were injected in the morning using a needle-less syringe with 10E5 cfu cm-2 PsmES4326 (suspended in 5mM MgSO4) or a MgSo4 control and were harvested 9, 24 or 32 hours later. Plants were grown in pots with BM-2 soil (Berger Peat Moss Ltd, Quebec, Canada) at a density of 9 plants per pot and kept at 22 degrees Celsius and 75% humidity with a 12 hour day length.
About the Experimenter
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Slides in this Experiment
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Hybridisation Set: Mitra: Arabidopsis thaliana leaves treated with Pseudomonas syringae ES4326_genome
Slide: Mitra_1-1_Mock-24h-B_Rep1_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
Summary InformationThis slide has had 1 extract(s) hybridised to it (1-colour).
The slide used was "Affymetrix ATH1 Arabidopsis Genome Array". Click on the options above for more information about this slide and its preparation. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hybridisation Protocol Information
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Protocols for BioSource 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Slide: Mitra_1-2_Mock-24h-C_Rep2_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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The slide used was "Affymetrix ATH1 Arabidopsis Genome Array". Click on the options above for more information about this slide and its preparation. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hybridisation Protocol Information
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Protocols for BioSource 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Extraction Protocol Information
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Slide: Mitra_1-3_Mock-24h-D_Rep3_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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The slide used was "Affymetrix ATH1 Arabidopsis Genome Array". Click on the options above for more information about this slide and its preparation. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hybridisation Protocol Information
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Protocols for BioSource 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Extraction Protocol Information
| Labelling Protocol Information
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| Array Design Information
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Scanning Protocol Information
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Slide: Mitra_1-4_Mock-32h-B_Rep1_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Hybridisation Protocol Information
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Protocols for BioSource 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Slide: Mitra_1-5_Mock-32h-C_Rep2_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Slide: Mitra_1-6_Mock-32h-D_Rep3_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Slide: Mitra_1-7_Mock-9h-B_Rep1_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Slide: Mitra_1-8_Mock-9h-C_Rep2_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Slide: Mitra_1-9_Mock-9h-D_Rep3_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Hybridisation Protocol Information
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Slide: Mitra_1-10_PsmES4326-24h-B_Rep1_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Protocols for BioSource 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Extraction Protocol Information
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Slide Information
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Scanning Protocol Information
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Slide: Mitra_1-11_PsmES4326-24h-C_Rep2_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Slide Information
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Scanning Protocol Information
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Slide: Mitra_1-12_PsmES4326-24h-D_Rep3_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Extraction Protocol Information
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Slide Information
| Array Design Information
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Scanning Protocol Information
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Slide: Mitra_1-13_PsmES4326-32h-B_Rep1_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Protocols for BioSource 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Extraction Protocol Information
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Slide Information
| Array Design Information
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Scanning Protocol Information
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Slide: Mitra_1-14_PsmES4326-32h-C_Rep2_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Hybridisation Protocol Information
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Protocols for BioSource 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Extraction Protocol Information
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Slide Information
| Array Design Information
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Scanning Protocol Information
| Image Analysis Information
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Slide: Mitra_1-15_PsmES4326-32h-D_Rep3_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Slide Information
| Array Design Information
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Scanning Protocol Information
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| Normalisation Information
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Slide: Mitra_1-16_PsmES4326-9h-B_Rep1_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Slide Information
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Scanning Protocol Information
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Slide: Mitra_1-17_PsmES4326-9h-C_Rep2_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Scanning Protocol Information
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Slide: Mitra_1-18_PsmES4326-9h-D_Rep3_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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