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Experiment: Transciptome differences between two vitamin C-deficient mutants and the wild type
Experiment Description
NASCArrays Experiment Reference Number: NASCARRAYS-390
The Arabidopsis mutant vtc2 is vitamin C-deficient and high light sensitive ((Müller-Moulé et al., 2002. Plant Physiol 128: 970-977; Müller-Moulé et al., 2003. Plant Physiol 133: 748-760). Even though the VTC2 gene has been cloned (Jander et al., 2002. Plant Physiol 129: 440-450), its function is still unclear. The goal of this experiment is to learn more about the function of the VTC2 gene by determining differences in the transcriptome of the wild type and the vtc2-1 mutant. In order to differentiate between VTC2 gene specific differences and vitamin C-induced differences, a second vitamin C-deficient mutant vtc1-1 (Conklin et al., 1996. PNAS 93: 9970-9974) is included in the experiment. The plants will be grown on agar plates in a growth chamber with a 16 hour light (about 40 µmol photons m⁻²s⁻¹)/8 hour dark regime at 20°C for 14 days to stage 1.04. Whole plants will be collected and total RNA will be isolated using the Qiagen Rneasy plant mini kit (Qiagen, Hilden, Germany).
About the Experimenter
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Slides in this Experiment
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Hybridisation Set: Mueller-Moule: two vitamin C-deficient mutants and the wild type
Slide: Mueller-Moule_1-1_Col-0_Rep1_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
Summary InformationThis slide has had 1 extract(s) hybridised to it (1-colour).
The slide used was "Affymetrix ATH1 Arabidopsis Genome Array". Click on the options above for more information about this slide and its preparation. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hybridisation Protocol Information
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BioSource 1 Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Slide: Mueller-Moule_1-2_Col-0_Rep2_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Slide: Mueller-Moule_1-3_Col-0_Rep3_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Slide: Mueller-Moule_1-4_vtc1_Rep1_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Slide: Mueller-Moule_1-7_vtc2_Rep1_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Slide: Mueller-Moule_1-8_vtc2_Rep2_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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Slide: Mueller-Moule_1-9_vtc2_Rep3_ATH1 | Add to Slide Selection | Get the data! |
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